Гипервариабельные и каркасные участки αβTCR

24.10.2015

Вариабельный (V) домен цепей (N-конец рецептора) содержит около 100 (87-113) аминокислотных остатков, константный (С) домен — 150. В свою очередь, V-домены каждой цепи (α и β) включают области высокой вариабельности, именуемые гипервариабельными участками. (Hypervariable region) или участками, определяющими комплементарность (CDR — Complementarity-determining region), В V-домене каждой цепи таких участков три: CDR1, CDR2 и CDR3. Наибольшей вариабельностью характеризуется участок CDR3. Эти участки отделены друг от друга областями с относительно постоянной аминокислотной последовательностью. Таких участков в V-домене 4, они называются каркасными участками (FR — Framework region) — FR1, FR2, FR3 и FR4. Гипервариабельные участки формируют АГ-распознающую область рецептора (АГ-связывающий участок или активный центр молекулы). Помимо указанных структур β-цепь рецептора включает 4-й гипервариабельный участок, не участвующий в распознавании антигена, но связывающий микробные продукты — суперантигены.
Спектр гомологичности V-доменов со сходной каркасной последовательностью колеблется в пределах 15-60%, каркасной последовательности — около 70%, С-доменов — 80%.