Verrucomicrobia

Verrucomicrobia (лат., от лат. verruca — бугорок) — тип бактерий, к которому относятся в основном некультивируемые формы. Как указывают метагеномные данные, в природе они распространены исключительно широко. Они составляют от 1 до 10 % почвенной микробиоты и потому имеют важное экологическое значение.

Описание

Представители Verrucomicrobia — грамотрицательные бактерии, у многих из которых на поверхности имеются простеки (бугорки), за что тип и получил своё название. Клетки — палочковидные, овоидные, одиночные или в парах, веретеновидные. У Prosthecobacter на одном из конце клетки имеется уникальное бульбовидное утолщение. По типу питания Verrucomicrobia — хемоорганогетеротрофы и сбраживают разнообразные сахара. Некоторые представители способны окислять метан при экстремально низких значениях рН.

Среди Verrucomicrobia есть анаэробы, факультативные анаэробы и аэробы; лучше всего представители филы растут при температуре 25 °C и pH от 4 до 7. Помимо почв, встречаются в пресноводных водоёмах, пелагиали и желудочно-кишечном тракте человека.

Систематика

По данным филогенетического анализа, ближайшими родственниками Verrumicrobia являются представители типа Chlamydiae. В 2008 году был секвенирован и опубликован геном одного из представителей типа, Methylacidiphilum infernorum. Его анализ указал на возможное родство Verrumicrobia и протеобактерий.

Филогения

Ниже представлено филогенетическое дерево Verrumicrobia, построенное по последовательностям 16S рРНК в рамках проекта The All-Species Living Tree.

Классификация

На декабрь 2017 года в тип включают следующие таксоны до рода включительно:

• Класс "Spartobacteria"

• Роды incertae sedis
  • Род Terrimicrobium

• Класс Opitutae Choo et al. 2007
  • Порядок Opitutales Choo et al. 2007
    • Семейство Opitutaceae Choo et al. 2007
      • Роды Alterococcus, Opitutus
  • Порядок Puniceicoccales Choo et al. 2007
    • Семейство Puniceicoccaceae Choo et al. 2007
      • Роды Cerasicoccus, Coraliomargarita, Pelagicoccus, Puniceicoccus
• Класс Verrucomicrobiae Hedlund et al. 1998 emend. Yoon et al. 2008
  • Порядок Verrucomicrobiales Ward-Rainey et al. 1996 emend. Yoon et al. 2008
    • Семейство Akkermansiaceae Hedlund and Derrien 2012
      • Род Akkermansia
    • Семейство Rubritaleaceae Hedlund 2012
      • Род Rubritalea
    • Семейство Verrucomicrobiaceae Ward-Rainey et al. 1996 emend. Takeda et al. 2008
      • Роды Brevifollis, Haloferula, Luteolibacter, Persicirhabdus, Prosthecobacter, Roseibacillus, Roseimicrobium, Verrucomicrobium
    • Роды incertae sedis
      • Род Limisphaera